[The 1st process コネクト]
B.C.2039、ニューヨーク。サイバードラッグに侵され錯乱した男が、女性を人質にして立てこもった。そこへ人造ワンマンアーミー・アリスが投入される。彼女が犯人の眉間に銃弾を撃ち込んだ瞬間、全世界のネットワークはXINNというコンピュータウィルスに支配された。すべてのコンピュータが演算を停止し、ヒステリックにXINNという文字をモニターに表記し始める…。
B.C.2039、TOKIO。帝室国家安全調査室特務課謀報局(帝謀)の大伴は、腕利きのエージェント御子神薫にマシー・スペクターの暗殺を指令した。彼はCIAから極秘テクノロジーをハッキングしたとされていた。
パートナーのアリスとの協力で、薫はなんとか指令を遂行した。だが、彼の記憶と人格は広大なネットの海を漂い、ドラッグを使用する人間の脳に侵入し、自らの狂気をさらに広めていく。この技術こそ、彼がCIAからハッキングしたものだった。そして、ネットの海の奥深くでは、マシーの人格さえも操る巨大なリヴァイアサンのような意思が蠢き始めていた……!?